Laboratory of Systematics and Geography of Fungi
История формирования отечественной микологии неразрывно связана со старейшими ботаническими научными учреждениями России — Аптекарским огородом Петра Первого (позже Императорским ботаническим садом и Главным ботаническим садом СССР) и Ботаническим музеем Академии наук, при объединении которых и возник Ботанический институт. Вклад микологов и фитопатологов Ботанического института в отечественную и мировую науку трудно переоценить. Среди них много блестящих имен, прославивших отечественную науку во всем мире.
В 1835 г. академик К.А. Триниус стал первым директором Ботанического музея Императорской Академии наук, а первым консерватором — Г.П. Бонгард. По их рекомендации чл.-корр. Академии наук И. А. Вейнман создает первую крупную сводку по грибам России — «Hymeno- et Gasteromycetes hucusque in Imperio rossico observatos» (1836). В 1893 г. директором музея был назначен выдающийся ботаник С.И. Коржинский, который пожертвовал музею два своих обширных гербария, частью которых, вероятно, был и микологический гербарий Б. Ауэрсвальда. С 1901 по 1902 г. директором музея был М.С. Воронин — ученик, сотрудник и друг А. Де Бари, один из основоположников отечественной микологии и фитопатологии, а с 1902 г. — И.П. Бородин — автор первого учебного пособия по микологии на русском языке («Краткий очерк микологии», 1897).
В 1900 г. в музее был организован самостоятельный Отдел низших споровых растений, к которому перешли коллекции водорослей, грибов, лишайников и мхов. Первым ученым хранителем Отдела становится ученик М. С. Воронина В.Г. Траншель — один из крупнейших представителей плеяды основоположников российской микологии.
Основанный в 1713 г. по Указу Петра Первого Аптекарский огород — предшественник БИН РАН — в 1823 г. преобразован в Императорский Ботанический сад при котором организуется гербарий, активно пополнявшийся коллекциями. Так, в 1841 г. была приобретена коллекция Г.А. Шрадера, в которой было значительное количество грибов. В 1898 г. из фондов гербария Императорского Ботанического сада выделяется Споровый гербарий, заведовать которым поручается А.А. Еленкину. В 1905 г. Споровый гербарий переводится в новое помещение, а в 1913 г. становится Институтом споровых растений.
В 1901 г. при Императорском Ботаническом саде организована Центральная фитопатологическая станция (ЦФС), ставшая главным центром по изучению грибов. Основатель ЦФС — выдающийся миколог и фитопатолог, чл.-корр. АН СССР А.А. Ячевский. Среди его трудов особое значение имеют первые в России «Определители грибов». Станцией заведовали последовательно А.А. Ячевский, А.А. Еленкин и А.С. Бондарцев. В 1913 г. станция преобразована в Отдел фитопатологии. Заведовал отделом А.С. Бондарцев, ученик Ф.В. Бухгольца, проработавший в институте почти 60 лет (с 1905 по 1963 гг.) и оставивший крупный след как фитопатолог, миколог, и организатор науки.
В 1931 г. был создан Ботанический институт АН СССР, а Отдел низших споровых растений Ботанического музея АН, Институт споровых растений и Отделы фитопатологии и гидробиологии Главного Ботанического Сада СССР были объединены в единый отдел споровых растений БИН АН СССР (зав. В.П. Савич), с выделением сектора микологии, которым стал заведовать В.Г. Траншель. В отделе работали выдающиеся микологи: Н.И. Васильевский, Б.П. Каракулин, В.Ф. Купревич, Р. Зингер (приехавший в СССР по приглашению Н.И. Вавилова), П.Н. Головин, Т.Л. Николаева, Б.П. Васильков и др.
В 1960 г. в отделе были выделены несколько лабораторий, в т. ч. лаборатория микологии (зав. М.А. Литвинов, затем — Н.С. Новотельнова). В 1979 г. в научный план в качестве основной темы включается «Определитель грибов СССР» (в настоящее время — «Определитель грибов России») — крупный проект, призванный обобщить все накопленные сведения о микобиоте страны. К настоящему времени опубликовано 15 книг.
В 1982 г. из Отдела низших растений был выделен Отдел микологии и лихенологии (зав. Н.С. Голубкова), состоящий из лаборатории лихенологии и бриологии, лаборатории систематики и географии грибов (зав. М.А. Бондарцева), лаборатории биохимии грибов (зав. Н.В. Белова) и группы прикладной микологии, позднее преобразованной в лабораторию экологии грибов (зав. Б.А. Томилин). Впоследствии разделение на Отделы было отменено, и структура института приобрела нынешний вид. С конца 1986 г. лабораторией систематики и географии грибов руководил А.Е. Коваленко.