Обзор современных программных средств, используемых для анализа геоботанических данных


А. Б. Новаковский


DOI: https://doi.org/10.31111/vegrus/2006.09.86


Аннотация статьи

Представлен обзор наиболее распространенных программных средств, используемых для анализа геоботанических данных. Рассмотрены их возможности, используемые алгоритмы, достоинства и недостатки. Для всех программ указаны интернет ссылки на сайты разработчиков.


Ключевые слова: классификация растительности, ординация, кластеризация


Рубрика: Методика исследований


Цитирование статьи

Новаковский А. Б. 2006. Обзор современных программных средств, используемых для анализа геоботанических данных // Растительность России.№ 9. С. 86–95. https://doi.org/10.31111/vegrus/2006.09.86


Получено 30 марта 2005 г.


Список литературы

Андреев В. Л. 1980. Классификационные построения в экологии и систематике. М. 142 с.

Василевич В. И. 1969. Статистические методы в геоботанике. Л. 230 с.

Голуб В. Б., Рухленко И. А., Халеев А. Е. 1995. Пакет программ для обработки геоботанических данных «ФИТОЦЕНОЛОГ» // II Совещ. «Компьютерные базы данных в ботанических исследованиях», СПб., БИН РАН, 1995: Тез. докл. СПб. С. 13—14.

Дегтева С. В. 2002. Сероольшаники Республики Коми //Бот. журн. Т. 87. № 1. С. 107—121.

Заугольнова Л. Б., Ханина Л. Г. 1996. Опыт разработки и использования баз данных в лесной фитоценологии // Лесоведение. № 1. С. 76—83.

Заугольнова Л. Б., Ханина Л. Г., Комаров А. С. 1995. Информационно-аналитическая система для определения сукцессионного статуса лесных сообществ. Препринт. Пущино. 51 с.

Заугольнова Л. Б., Ханина Л. Г., Глухова Е. М. 1999. Создание базы данных и информационно-диагностической системы для определения синтаксономических адресов лесных сообществ Европейской России // Информационно-поисковые системы в зоологии и ботанике: Междунар. симпоз. СПб. С. 84. (Тр. ЗИН РАН; Т. 278).

Зверев А. А. 1995. Опыт разработки интегрированной ботанической информационной системы (IBIS) // II Совещ. «Компьютерные базы данных в ботанических исследованиях». СПб., БИН РАН, 1995: Тез. докл. СПб. С. 19—20.

Ким Дж.-О., Мьюллер Ч. У. 1989. Факторный анализ: статистические методы и практические вопросы // Факторный, дискриминантный и кластерный анализ / Под ред. И. С. Енюкова. М. C. 5—77.

Кушнарев Е. Л. 1983. Применение графических методов анализа при изучении видовой структуры орнитосообществ по экологическому профилю // Теоретико-графовые методы в биогеографических исследованиях. Владивосток. С. 33—48.

Лебедева Н. В. , Криволуцкий Д. А. 2002. Биологическое разнообразие и методы его оценки. М., 432 с.

Липский В. 1988. Комбинаторика для программистов. М. 213 с.

Миркин Б. М., Наумова Л. Г., Соломещ А. И. 2000. Современная наука о растительности. М. 263 с.

Нешатаев В. Ю. 1997. Метод упорядочивания фитоценотических таблиц в Информационно-статистиче­ской системе ECOPHYTO // Междунар. конф. ­«Компьютерные базы данных в ботанических исследованиях»: Тез. докл. СПб. С. 73—75.

Нешатаев В. Ю. 1999. Геоботаническая информационно-статистическая система ECOPHYTO // Организация научных исследований в заповедниках и национальных парках. М. С. 208—223.

Нешатаев Ю. Н. 1987. Методы анализа геоботаниче­ских материалов. Л. 190 с.

Новаковский А. Б. 2004. Возможности и принципы работы программного модуля «GRAPHS». Сыктывкар. 28 c. (Препринт; сер. «Автоматизация научных исследований»).

Пузаченко Ю. Г. 2004. Математические методы в экологических и географических исследованиях. М. 416 с.

Свами М., Тхуласираман К. 1984. Графы, сети и алгоритмы. М. 454 с.

Семкин Б. И., Наумова В. В., Варченко Л. И., Борзова Л. М. 1983. Об использовании мер зависимости для определения степени ассоциации видов растений // Теоретико-графовые методы в биогеографических исследованиях. Владивосток. С. 20—32.

Ту Дж., Гонсалес Р. 1978. Принципы распознавания образов. М. 416 с.

Уиллиамс У. Т., Ланс Дж. Н. 1986. Методы иерархической классификации // Статистические методы для ЭВМ. М. С. 269—301.

Уланова Н. Г. 1995. Математические методы в геоботанике. М. 109 с.

Шитиков В. К., Розенберг Г. С., Зинченко Т. Д. 2003. Количественная гидроэкология: методы системной идентификации. Тольятти. 463 с.

Шмидт В. М. 1984. Математические методы в ботанике. Л. 287 с.

McCune B., Grace J. B., Urban D. L.. 2002. Analysis of ecological communities. MjM Software Design, Oregon. 285 p.

Bruilheide H. 1997. Using formal logic to classify vegetation // Folia Geobot. Phytotax. Vol. 32. N 1. P. 41—46. https://doi.org/10.1007/BF02803883

Bruilheide H. 2000. A new measure of fidelity and its appli­cation to defining species groups // J. Veg. Sci. Vol. 11. P. 167—178. https://doi.org/10.2307/3236796

Dufrene M., Legendre P. 1997. Species assemblages and indicator species: the need for a flexible asymmetrical approach // Ecological monographs. Vol. 67. N 3. P. 345—365. https://doi.org/10.2307/2963459

Hennekens S. M. 1996. TURBO(VEG). Software package for input, processing and presentation of phytosocio­logical data. IBN-DLO. Wageningen, NL and University of Lancaster. Lancaster, UK. 59 p.

Hennekens S. M., Schaminee J. H. J. 2001. TURBOVEG, a comprehensive database management system for vegetation data // J. Veg. Sci. Vol. 12. P. 589—591. https://doi.org/10.2307/3237010

Hill M. O. 1994. DECORANA and TWINSPAN for ordina­tion and classification of multivariate species data: a new edition, together with supporting programs, in FORTRAN 77. Institute of Terrestrial Ecology. Huntingdon, UK. 58 p.

Jongman R. H. G., Ter Braak C. J. F., Van Tongeren O. F. R. 1987. Data analysis in community and landscape ecology. Wageningen. 299 p.

Legendre P., Legendre L. 1998. Numerical Ecology. 2nd ed. Amsterdam. 853 p.

Tichy L. 2002. JUICE, software for vegetation classification // J. Veg. Sci. Vol. 13. P. 451—453. http://www.sci.muni.cz/botany/juice/jvs.pdf https://doi.org/10.1111/j.1654-1103.2002.tb02069.x

Tichy L. 2003. Formalized reproduction of an expert-based phytosociological classification: A case study of sub­alpine tall-forb vegetation // J. Veg. Sci. Vol. 14. P. 601—610. http://www.sci.muni.cz/botany/juice/JVS2003b.pdf https://doi.org/10.1111/j.1654-1103.2003.tb02187.x