Олег Николаевич Щепин

Идентификационные коды автора: Web of Science ResearcherID, Scopus Author ID, РИНЦ, ORCID iD, Google Scholar

Ученая степень, ученое звание: кандидат биологических наук

Должность: старший научный сотрудник

Электронная почта: OShchepin@binran.ru

Направления исследований:

Эволюция, экология, систематика и география миксомицетов (Myxomycetes). Используемые методы — ДНК-баркодинг, ДНК-метабаркодинг (ампликонная метагеномика), генотипирование (GBS), молекулярная филогенетика.

Ключевые слова: Amoebozoa, миксомицеты, видообразование, протисты, скрытое разнообразие, филогеография, биогеография

Образование и опыт работы:

2009–2014 — Санкт-Петербургский государственный университет, биологический факультет, кафедра цитологии и гистологии. Бакалавр биологии, диплом с отличием. Дипломная работа: «Анализ плоидности ядер миксамеб и плазмодиев миксомицета Lepidoderma chailletii Rostaf. в условиях культивирования».
2014–2016 — Санкт-Петербургский государственный университет, биологический факультет, кафедра цитологии и гистологии. Магистр биологии, диплом с отличием. Дипломная работа: «Анализ репродуктивной структуры популяций модельных видов нивальных миксомицетов».
2016–2020 — Ботанический институт им. В.Л. Комарова РАН, очная аспирантура.
2015–2016 — Институт биоинформатики, Санкт-Петербург, программа «Биоинформатика для биологов».
2021 — степень кандидата биологических наук, тема диссертации «Скрытое разнообразие темноспоровых миксомицетов (Myxomycetes): таксономический и экологический аспекты».

2016–2020 — Ботанический институт им. В.Л. Комарова РАН, лаборатория систематики и географии грибов, младший научный сотрудник.
2020 — по настоящее время — Ботанический институт им. В.Л. Комарова РАН, лаборатория систематики и географии грибов, старший научный сотрудник, ученый секретарь лаборатории.

Научные проекты:

Исполнитель:

2022–2023. РНФ № 22-24-00747 «Реконструкция «глубокой филогении» грибообразных протистов (Myxomycetes = Eumycetozoa) на основе данных, полученных методом «genome skimming»».
2021–2023. Соглашение с Минобрнауки № 075-15-2021-1056, тема «Гербарные фонды биологического разнообразия растений и грибов Коллекционного фонда Ботанического института им. В.Л. Комарова РАН: модернизация, развитие и сетевое взаимодействие как основа фундаментальных исследований и совершенствования генетических технологий».
Тема «Эколан Э-1.5». Таксономическое и экологическое разнообразие микобиоты тропических лесов Вьетнама.
2018–2020. РФФИ № 18-04-01232 А «ДНК-штрихкодирование миксомицетов (Myxomycetes = Myxogastria) и анализ их скрытого разнообразия на основе гербарных коллекций и метагеномных данных».
2015–2017. РФФИ № 15-29-02622 «Оценка «скрытого разнообразия» высших грибов и миксомицетов в почвах уязвимых природных экосистем на основе метагеномного подхода и классического молекулярного анализа».
2016–2017. РФФИ № 16-34-00510 «Ревизия рода Trichoglossum (Geoglossaceae, Ascomycota) на основе комплексного таксономического анализа».
2015–2017. РФФИ № 15-04-07692 «Видовой состав и структура сообществ миксомицетов пойменных дубрав природного парка «Волго-Ахтубинская пойма»».
2014–2016. РФФИ № 14-04-01408 «Адаптивные стратегии грибообразных амебоидных протистов в экстремальных условиях субаридных экосистем, на примере Внутренней Азии (Российская часть)».
2013–2015. РФФИ № 13-04-00839 «Генетические и экологические аспекты биогеографии нивальных миксомицетов (Myxomycetes) альпийских и равнинных ландшафтов».
2012–2013. РФФИ № 12-04-31262 «Роль гидрохории в расселении наземных грибообразных протистов (Myxomycetes) в интразональных пойменных лесах юга Сибири».

Прочие проекты:

Электронная информационная система референсных нуклеотидных последовательностей (ДНК-штрихкодов) миксомицетов MyxoSeq — Новожилов Ю.К.

Научные мероприятия:

Организация мероприятий:

Biodiversity: Genomics and Evolution (BioGenEvo-2018). Symposium. Россия, Новосибирск, 21–24 августа 2018 г. Член оргкомитета.

Участие:

10th International Congress on Systematics and Ecology of Myxomycetes. Коста Рика, Турриальба, 25–28 февраля 2020 г. Устные и постерные доклады.
4-th Thünen Symposium on Soil Metagenomics. Германия, Брауншвейг, 11–13 декабря 2019 г. Постерный доклад.
IV (XII) Международная ботаническая конференции молодых ученых в Санкт-Петербурге. Россия, Санкт-Петербург, 22–28 апреля 2018 г. Ведущий семинара.
9th International Congress on Systematics and Ecology of Myxomycetes. Япония, Танабе, 18–23 августа 2017 г. Устные доклады.
VIII Всероссийская микологическая школа-конференция с международным участием «Концепции вида у грибов: новый взгляд на старые проблемы». Россия, Москва, 30 июля — 5 августа 2017 г. Устный доклад.

Экспедиции:

Россия (Кольский п-ов, Дальний Восток, Северный Кавказ).
Германия (Баварские Альпы).
Испания (Сьерра Невада).

Редакционная деятельность:

Член редколлегии (младший редактор) журнала «Karstenia»
Член редколлегии журнала «Slime Molds»

Научно-организационная и педагогическая деятельность:

Чтение учебных курсов:

Чтение лекций для аспирантов БИН РАН по курсу «Микология»

Избранные публикации:

Shchepin O.N., Novozhilov Y.K., Woyzichovski J. et al. Genetic structure of the protist Physarum albescens (Amoebozoa) revealed by multiple markers and Genotyping by Sequencing. Molecular Ecology. 2021. 31(1): 372-390.

Dagamac N.H.A., Bauer B., Woyzichovski J., Shchepin O.N., Novozhilov Y.K., Schnittler M. Where do nivicolous myxomycetes occur? – Modeling the potential worldwide distribution of Physarum albescens. Fungal Ecology. 2021. 53: 1754-5048.

Woyzichovski J., Shchepin O.N., Dagamac N.H.A., Schnittler M. More than just diameter: a workflow for automated image analysis of spore shapes in myxomycetes. PeerJ. 2021. 9: e12471.

Bortnikov F.M., Matveev A.V., Gmoshinskiy V.I., Novozhilov Yu.K., Zemlyanskaya I.V., Vlasenko A.V., Schnittler M., Shchepin O.N. Myxomycetes of Russia: a history of research and a checklist of species. Karstenia. 2020. 58(2): 316-373.

Schnittler M., Dagamac N.H.A., Leontyev D., Shchepin O., Novozhilov Y.K., Klahr A. Quick n’ Cheap – a simplified workflow to barcode plasmodial slime molds (Myxomycetes). Karstenia. 2020. 58(2): 385-392.

Novozhilov Yu.K., Shchepin O.N., Gmoshinskiy V.I., Schnittler M. Myxomycetes of boreal forests of the Laplandskiy State Nature Biosphere Reserve (Kola Peninsula, Russia). Karstenia. 2020. 58(2): 292-315.

Novozhilov Y.K., Shchepin O.N., Schnittler M., Dagamac N.H.A., Alexandrova A.V., Popov E.S., Kuznetsov A.N. Myxomycetes associated with mountain tropical forests of Bidoup Nui Ba and Chu Yang Sin national parks (Dalat Plateau, southern Vietnam). Nova Hedwigia. 2020. 110(1-2): 185-224.

Leontyev D.V., Schnittler M., Stephenson S.L., Novozhilov Y.K., Shchepin O.N. Towards a phylogenetic classification of the Myxomycetes. Phytotaxa. 2019. 399(3): 209-238.

Shchepin O.N., Schnittler M., Erastova D.A., Prikhodko I.S., Borg Dahl M., Azarov D.V., Chernyaeva E.N., Novozhilov Y.K. Community of dark-spored myxomycetes in ground litter and soil of taiga forest (Nizhne-Svirskiy Reserve, Russia) revealed by DNA metabarcoding. Fungal Ecology. 2019. 39: 80-93.

Shchepin O.N., Schnittler M., Dagamac N.H.A., Leontyev D.V., Novozhilov Y.K. Unexplored diversity of the tiniest myxomycetes: evidences from environmental DNA. Plant Ecology and Evolution. 2019. 152(3): 499-506.

Gao Y., Zhang X., He G., Shchepin O.N., Yan S., Chen S. Influence of forest type on dark-spored myxomycete community in subtropical forest soil, China. Soil Biology and Biochemistry. 2019. 139: 107606.

Borg Dahl M., Shchepin O.N., Schunk C., Menzel A., Novozhilov Y.K., Schnittler M. A four year survey reveals a coherent pattern between occurrence of fruit bodies and soil amoebae populations for nivicolous myxomycetes. Sсientific Reports. 2018. 8: 11662.

Novozhilov Yu.K., Shchepin O.N., Alexandrova A.A., Popov E.S., Dagamac N.H.A. Altitudinal patterns of diversity of myxomycetes (Myxogastria) across tropical forests of Southern Vietnam. Protistology. 2018. 12(2): 73-80.

Shchepin O.N., Novozhilov Y.K., Schnittler M. Disentangling the taxonomic structure of the Lepidoderma chailletii-carestianum species complex (Myxogastria, Amoebozoa): genetic and morphological aspects. Protistology. 2017. 10(4): 117-129.

Schnittler M., Shchepin O.N., Dagamac N.H., Dahl M.B., Novozhilov Y.K. Barcoding myxomycetes with molecular markers: challenges and opportunities. Nova Hedwigia. 2017. 104(1-3): 323-341.

Novozhilov Y.K., Erastova D.A., Shchepin O.N., Schnittler M., Alexandrova A.V., Popov E.S., Kuznetzov A.N. Myxomycetes associated with monsoon lowland tropical forests in southern Vietnam. Nova Hedwigia. 2017. 104(1-3): 143-182.

Novozhilov Y.K., Schnittler M., Erastova D.A., Shchepin O.N. Myxomycetes of the Sikhote-Alin State Nature Biosphere Reserve (Far East, Russia). Nova Hedwigia. 2017. 104(1-3): 183-209.

Shchepin O.N., Dagamac N.H., Sanchez O.M., Novozhilov Y.K., Schnittler M., Zemlyanskaya I.V. DNA barcoding as a tool for identification of plasmodia and sclerotia of myxomycetes (Myxogastria) appearing in moist chamber cultures. Mycosphere. 2017. 8(10): 1904-1913.

Власенко А.В., Новожилов Ю.К., Щепин О.Н., Власенко В.А. Гидрохория как один из способов расселения миксомицетов в пойменных биотопах юга западной Cибири. Микология и фитопатология. 2016. 50(1): 14-23.

Schnittler M., Erastova D.A., Shchepin O.N., Heinrich E., Novozhilov Y.K. Four years in the Caucasus – observations on the ecology of nivicolous myxomycetes. Fungal Ecology. 2015. 14: 105-115.

Shchepin O.N., Novozhilov Y.K., Schnittler M. Nivicolous myxomycetes in agar culture: some results and open problems. Protistology. 2014. 8(2): 53-61.

Novozhilov Y.K., Mitchell D.W., Okun M.V., Shchepin O.N. New species of Diderma from Vietnam. Mycosphere. 2014. 4(2): 363-454.

Novozhilov Y.K., Okun M.V., Erastova D.A., Shchepin O.N., Zemlyanskaya I.V., Garcia-Carvajal E., Schnittler M. Description, culture and phylogenetic position of a new xerotolerant species of Physarum. Mycologia. 2013. 105(6): 1535-1546.

Novozhilov Y.K., Schnittler M., Erastova D.A., Shchepin O.N., Okun M.V., Heinrich E. Diversity of nivicolous myxomycetes of the Teberda State Biosphere Reserve (Northwestern Caucasus, Russia). Fungal Diversity. 2012. 59: 109-130.